Identification of the microbiome present in sputum samples from patients with clinical tuberculosis by NGS (Next Generation Sequencing)

Disciplina académico-profesional: Biología

Identification of the microbiome present in sputum samples from patients with clinical tuberculosis by NGS (Next Generation Sequencing)
  • Autor(es): Ttito Velasquez, Karina Revilla Mogrovejo, Carmen Rosa
  • Asesor(es): Del Carpio Sanz, Ada Otilia
  • Fecha: 2022
  • Institución: Universidad Nacional de San Agustín de Arequipa
  • Jurado: Ramos Paredes, Adolfo Roman; Valdez Ortiz, María Del Carmen; Del Carpio Sanz, Ada Otilia
  • Disciplina académico-profesional: Biología
  • Grado o título: Biólogas
  • Institución que otorga el grado o título: Universidad Nacional de San Agustín de Arequipa.Facultad de Ciencias Biológicas
  • Fecha de registro: 18-jul-2022

Resumen de la Tesis

La tuberculosis es una enfermedad reemergente que continúa siendo un problema de salud pública a nivel mundial con una alta tasa de morbimortalidad. La infección por M. tuberculosis provoca disbiosis de la microbiota, condición que no solo influye en la latencia de M. tuberculosis y en la manifestación de la enfermedad. Otro aspecto a considerar son los métodos de diagnósticos los cuales son variados y con limitaciones, sin embargo, gracias a los notables avances tecnológicos como la Secuenciación de Nueva Generación (NGS). En el presente estudio se realizó la identificación del Microbioma de muestras de pacientes con diagnóstico de tuberculosis, donde se recolectaron 28 muestras de esputo con diagnóstico clínico de tuberculosis correspondientes a: 20 sin tratamiento, 6 con tratamiento, 2 Multidrogo – Resistente y 8 muestras de pacientes sin tuberculosis (control). Para la identificación de M. tuberculosis se utilizaron los cebadores TB1, TB2 y TB3. La identificación molecular del Microbioma se realizó mediante secuenciación Illumina MiSeq, utilizando cebadores específicos que se dirigen a la región V4 del gen 16S rRNA. De acuerdo con la abundancia de cada grupo de estudio, se presentaron los siguientes Filos: pacientes sin tuberculosis (control) Firmicutes ,Bacteroidetes, Proteobacterias, Fusobacterias y Actinobacterias; pacientes con diagnóstico de tuberculosis sin tratamiento: Firmicutes, Proteobacteria, Bacteroidetes, y Actinobacteria; pacientes con diagnóstico de tuberculosis que recibieron tratamiento Firmicutes, Proteobacteria, Bacteroidetes y Actinobacteria ;pacientes con diagnóstico de tuberculosis Multidrogo-resistentes Filos Proteobacteria, , Bacteroidetes, Firmicutes y Actinobacteria . El estudio identificó la diversidad y abundancia a nivel de filo y género mediante Secuenciamiento de Nueva Generación, encontrando una marcada variación en el Microbioma presente en muestras de esputo asociado a tuberculosis.

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¿Cuatro puntos importantes para elaborar una tesis con éxito?

Estos cuatro puntos son fundamentales para elaborar la tesis, así que presta atención para que puedas elaborar tu investigación con mucho éxito.

  1. Título: Tiene que ser un texto que resuma el tema que se busca investigar. Busca que sea concreto, acotado y con un alto nivel de claridad.
  2. Problema: Ya con el título, debes colocar un apartado donde se indique cuál es el problema a evaluar o tratar, esto tiene que estar vinculado con el tema central. Ten en cuenta que a la hora de plantear el problema, es práctico recordar que si no existe problema no hay necesidad de estudio.
  3. Hipótesis: En la hipótesis tenemos que plantear, a través de uno o más argumentos, aquello que consideras que supone el problema de tu investigación.
  4. Metodología: Cuando menciones la metodología debes dejar en claro cuáles son las herramientas a las que recurrirás. ¿Realizarás encuestas? ¿Recurrirás a material bibliográfico? Identifica cuántas y cuáles son.

¿Cuáles son las partes de una tesis?

  1. Concebir la idea de investigación
  2. Planteamiento del problema
  3. Marco Contextual
  4. Marco teórico
  5. Definición del tipo de investigación
  6. Formulación de la hipótesis
  7. Diseño de la investigación
  8. Selección de la muestra
  9. Recolección de datos
  10. Análisis de los datos
  11. Elaboración del reporte de investigación
  12. Recomendaciones generales

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  • Enlace al repositorio: http://hdl.handle.net/20.500.12773/14449
  • Campo OCDE: https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.03.08
  • Palabras clave: Microbioma Tuberculosis NGS

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